Инсерционный полиморфизм Alu-ретроэлементов и его влияние на транскрипционную активность генов человека



Реферат:По результатам полногеномного экспериментального сравнительного анализа и биоинформатического поиска создана интернет-база данных, содержащая сведения об известных на настоящий момент полиморфных интеграциях ретроэлементов. Разработан метод полуколичественной ОТ-ПЦР для сравнения уровня транскрипции аллельных вариантов генов человека. Выявлен ингибирующий эффект интеграции Alu на содержание транскрипта Alu+ аллеля гена, и показана тканеспецифичность проявления обнаруженного эффекта. Показано, что в исследованной выборке ингибирующий эффект интронных инсерций Alu не зависит от принадлежности Alu-элемента к филогенетической группе AluY-повторов, ориентации ретроэлемента относительно направления транскрипции гена, положения интеграции в гене и нуклеотидной последовательности индивидуального Alu-элемента. Методом торможения в геле показано различие в профилях связывания Alu-содержащих фрагментов в сравнении с Alu-несодержащими фрагментами ДНК с ядерных белков клеточных линий. Полученные результаты расширяют существующие представления о Alu-ретроэлементах как о важных функциональных единицах генома, модулирующих активность многих генов человека и могут использоваться в фундаментальных и клинических исследованиях.
Автор: Амосова Анна Леонидовна
Тип диссертации:1
Дата защиты:May 30, 2007
Количество страниц:97
Руководители: Лебедев Ю.Б.
Оппоненты: Куприянова Н.С.
Рубцов П.М.
Ключевые слова: